1938年1月，新四军军部和中共中央长江局东南分局在南昌正式办公，中共闽赣省委随即接到东南分局的指示，撤销中共闽赣省委，改设为中共闽浙赣特委，曾镜冰任书记，下辖建松政和邵武两个中心县委及崇安、浦城、顺阳、光泽、上饶、铅山等7个县委。新四军第三支队第五团北上抗日后，闽北游击区仍是国民党统治区域。这一时期，民族矛盾和阶级矛盾错综复杂地结合在一起，党中央分析了当前形势，要求南方各游击区“灵活的全面的改变自己的一切工作”，“保存与巩固革命武装”，“严防对方瓦解与消灭我们的阴谋诡计与包围袭击”，并明确提出了“独立自主靠山扎”的方针。

中共闽浙赣特委结合实际情况，贯彻党中央“独立自主靠山扎”的方针，将立足点扎在山上，并敢于留人、留枪，保留自卫武装，使队伍不断发展壮大，成为保卫闽浙赣边区的主要支柱。为了便于进行合法斗争，中共闽浙赣特委在崇安长涧源建立了合法的组织——新四军三支队崇安留守处。留守处对外是新四军留守机构，对内实际上是中共闽浙赣特委机关。这一时期，在曾镜冰、汪林兴领导下，新四军三支队崇安留守处广泛深入开展抗日救亡运动，大力发展党的组织，动员一切力量争取抗战胜利，并以武装隐蔽进行秘密工作，依靠武装作后盾，保证为争取政治、经济权利而进行的合法斗争的胜利开展。