民国38年5月，闽北大部分县解放，9月境内设两个行政督察专员公署，为福建省人民政府的派出机构，即第一行政督察专员公署，驻建瓯；第二行政督察专员公署，驻南平。

1950年3月，为便于与民国建制的识别，省人民政府通知行政督察专员公署改冠以驻县名。4月1日，第一行政督察专员公署改名建瓯行政督察专员公署，第二行政督察专员公署改名南平行政督察专员公署。9月27日，建瓯行政督察专员公署驻地迁至建阳，改称建阳行政督察专员公署。11月1日，建阳、南平两公署分别改称福建省建阳区专员公署、福建省南平区专员公署。1955年3月，又分别改称建阳专员公署、南平专员公署。1956年3月26日，撤销建阳专员公署，所属各县划归南平专员公署。

“文化大革命”中，1967年2月19日成立南平地区革命造反委员会。3月18日，南平地区革命造反委员会改称南平地区革命委员会。1968年5月15日，根据福建省军区的指示，改称为南平专区革命委员会。

1970年9月，南平专区驻地迁驻建阳。1971年7月1日，正式挂牌称建阳地区革命委员会。1978年3月，撤销建阳地区革命委员会，成立福建省建阳地区行政公署。

1983年10月，邵武撤县建市。1988年10月24日，经国务院批准建阳地区驻地迁回南平，1989年1月1日，正式更名为南平地区行政公署。1989年8月，崇安撤县设市更名为武夷山市。1992年12月，建瓯撤县设市。1994年3月，建阳撤县设市。1994年9月，国务院批准撤销南平地区设立地级南平市，原县级南平市同时改设为延平区，南平地区建制至次年1月18日终止。2014年5月，经国务院批准，建阳撤市设区，以原建阳市的行政区域为建阳区的行政区域；南平市政府驻地由南平市八一路439号迁至南平市建阳区南林大街36号。2019年底，南平市行政中心驻地正式由延平区迁至建阳区。